RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 ZEB2O60315 1214 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CNMDO75829 334 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CHGBP05060 677 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 RARBP10826 455 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CTGFP29279 349 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC4A3P48751 1232 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 HAND2P61296 217 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CPXCR1Q8N123 301 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 NCOA7Q8NI08 942 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIB2Q92519 343 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 USP6NLQ92738 828 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MTA3Q9BTC8 594 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SIPA1L1O43166 1804 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SEPT4O43236 478 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 KDM4AO75164 1064 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 AKR1A1P14550 325 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CHMLP26374 656 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 KIF5BP33176 963 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT32Q14532 448 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 VPS53Q5VIR6 699 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF180Q86T96 592 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PNMA1Q8ND90 353 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TINF2Q9BSI4 451 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 DNM1LO00429 736 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SGSM2O43147 1006 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 REC8O95072 547 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ICAM1P05362 532 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CALM1P0DP23 149 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CALM2P0DP24 149 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CALM3P0DP25 149 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ALAS1P13196 640 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 NOVP48745 357 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 GNAQP50148 359 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 FGD1P98174 961 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 EVX2Q03828 476 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 KCTD1Q719H9 257 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKS1AQ92625 1134 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MAML3Q96JK9 1138 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MTMR7Q9Y216 660 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TNKSO95271 1327 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC69A6NI79 296 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CDC45O75419 566 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PDHBP11177 359 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CYBAP13498 195 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP2C19P33261 490 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MCM5P33992 734 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF543Q08ER8 600 aa6.53□□□□□ -1.36
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