RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539741.5

TM7SF3-208, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-208ENST00000539741 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3-208ENST00000539741 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3-208ENST00000539741 SPATA32Q96LK8 384 aa23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3-208ENST00000539741 TMX2Q9Y320 296 aa23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3-208ENST00000539741 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3-208ENST00000539741 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3-208ENST00000539741 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 KIF28PB7ZC32 967 aa23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 F5H6K3 240 aa23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 UBE2HP62256 183 aa23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 KLRC3Q07444 240 aa23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 NDUFB10O96000 172 aa23■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 NLRP5P59047 1200 aa23■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 BARHL2Q9NY43 387 aa23■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 YEATS4O95619 227 aa22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 GJA5P36382 358 aa22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 RAD21O60216 631 aa22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 ARHGEF6Q15052 776 aa22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 PTPN18Q99952 460 aa22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 BTBD18B2RXH4 712 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 STXBP3O00186 592 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 BMP3P12645 472 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 KCTD1Q719H9 257 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 HOMER1Q86YM7 354 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 ZNF333Q96JL9 665 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 USP28Q96RU2 1077 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 VCPKMTQ9H867 229 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 CENPFP49454 3210 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 A0A1W2PRG0 241 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 ESYT2A0FGR8 921 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 SHISA4Q96DD7 197 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 MTMR8Q96EF0 704 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 PIGSQ96S52 555 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 FEZ1Q99689 392 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 ELP3Q9H9T3 547 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 DOCK1Q14185 1865 aa22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3-208ENST00000539741 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 NAPAP54920 295 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 CAP1Q01518 475 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 ACER1Q8TDN7 264 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 OPTNQ96CV9 577 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 WRNIP1Q96S55 665 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 CPVLQ9H3G5 476 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 PICK1Q9NRD5 415 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 ZBTB5O15062 677 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 GNA11P29992 359 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 STK38Q15208 465 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 ANO1Q5XXA6 986 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 BLIDQ8IZY5 108 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 BICD2Q8TD16 824 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 LPAR1Q92633 364 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 C6orf50Q9HD87 102 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 PLA2G6O60733 806 aa22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 TRAF1Q13077 416 aa22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3-208ENST00000539741 NR5A1Q13285 461 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms