RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GIPC2Q8TF65 315 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SGSM3Q96HU1 749 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYH8P13535 1937 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.63□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDC14CA4D256 554 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF213O14771 459 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRDX5P30044 214 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP5P45974 858 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHKA2P46019 1235 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TDO2P48775 406 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTH1RQ03431 593 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRDNQ13061 729 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAPBQ9H115 298 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARMT1Q9H993 441 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SBF1O95248 1867 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCN9AQ15858 1988 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GTH6 734 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 F8W031 263 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCM2P49736 904 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEKT1Q969V4 418 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.62□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC27A2O14975 620 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLA2G4AP47712 749 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NECTIN1Q15223 517 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALX1Q15699 326 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC51AQ86UW1 340 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SYT17Q9BSW7 474 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRIQ9BWK5 157 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOCADQ5VW36 1801 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM196BA6NMK8 535 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L15C9J2P7 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L10C9JJH3 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L12C9JPN9 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L11C9JVI0 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L21D6R901 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L18D6R9N7 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L22D6RA61 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L19D6RCP7 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L20D6RJB6 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDK2AP1O14519 115 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGAP02671 866 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BTDP43251 543 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEK4P51957 841 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPHA4P54764 986 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L24Q0WX57 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD1Q15327 319 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX11Q8IYF3 940 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LCORLQ8N3X6 602 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEK1Q96PY6 1258 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL25Q9H293 177 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms