RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	SRL	Q86TD4	932 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ABCB11	O95342	1321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	POTEB2	H3BUK9	544 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	COBL	O75128	1261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	MECOM	Q03112	1051 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	PDILT	Q8N807	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	BAP1	Q92560	729 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	EPHB6	O15197	1021 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CLSTN1	O94985	981 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ACTN2	P35609	894 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	AFM	P43652	599 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	GYG1	P46976	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	STX17	P56962	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF174	Q15697	407 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	HDX	Q7Z353	690 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	SLC51A	Q86UW1	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CYP2D6	P10635	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CYP7A1	P22680	504 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	KLK7	P49862	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	C12orf60	Q5U649	245 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	TDO2	P48775	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	LAD1	O00515	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	TUBB	P07437	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	SPAG1	Q07617	926 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTSC-208	ENST00000533897	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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