RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 ZBTB5O15062 677 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC10A3P09131 477 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT2P35908 639 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 SPRYD7Q5W111 196 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 CLIC4Q9Y696 253 aa25.24■■□□□ 1.63
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PACSIN3-209ENST00000532457 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIM75PA6NK02 468 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 M0R2N6 131 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 BACE1P56817 501 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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PACSIN3-209ENST00000532457 IRF6O14896 467 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 NAPAP54920 295 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 HTRA3P83110 453 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.22■■□□□ 1.63
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PACSIN3-209ENST00000532457 TRAK2O60296 914 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 STAT2P52630 851 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 GRM1Q13255 1194 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 BLIDQ8IZY5 108 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 CAPNS2Q96L46 248 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 CEP350Q5VT06 3117 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 SMCO2A6NFE2 343 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 GTF2A2P52657 109 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 NOGQ13253 232 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 SNAPC2Q13487 334 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 GPT2Q8TD30 523 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 SPATA32Q96LK8 384 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 CFAP45Q9UL16 551 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PLA2G6O60733 806 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 USP14P54578 494 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 ATL3Q6DD88 541 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 LPAR1Q92633 364 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 C19orf81C9J6K1 198 aa25.19■■□□□ 1.62
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PACSIN3-209ENST00000532457 CALML3P27482 149 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 GJA5P36382 358 aa25.19■■□□□ 1.62
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PACSIN3-209ENST00000532457 FEM1BQ9UK73 627 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 WNT7AO00755 349 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 HMGCS2P54868 508 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PGBD1Q96JS3 809 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 ANO1Q5XXA6 986 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 CETPP11597 493 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 INHBEP58166 350 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 GALNT17Q6IS24 598 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PCNTO95613 3336 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM160B2Q86V87 743 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 ELP1O95163 1332 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 ESYT2A0FGR8 921 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 VEGFBP49765 207 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 SREBF2Q12772 1141 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPAQ15257 358 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 C12orf42Q96LP6 360 aa25.16■■□□□ 1.62
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