RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYOG	P15173	224 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDE6A	P16499	860 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	EVX2	Q03828	476 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDK8	P49336	464 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	NKX3-2	P78367	333 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	AACS	Q86V21	672 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ACTN1	P12814	892 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	BEX3	Q00994	111 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	REV3L	O60673	3130 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	RFXAP	O00287	272 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADCY6	O43306	1168 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	CA3	P07451	260 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASB14	A6NK59	587 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	CTAGE5	O15320	804 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	SCLY	Q96I15	445 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP17L21	D6R901	530 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691		F5H6K3	240 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	GOLIM4	O00461	696 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	B4GALT4	O60513	344 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	OAZ1	P54368	228 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	KLRC3	Q07444	240 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TXNRD1-223	ENST00000531691	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRKAB2	O43741	272 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	MBD4	O95243	580 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	RFC2	P35250	354 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	KATNBL1	Q9H079	304 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691		Q9Y3F1	56 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	NDUFB10	O96000	172 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	FDX1	P10109	184 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALAD	P13716	330 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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