RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529457.1

SUMF2-218, Transcript of sulfatase modifying factor 2, humanhuman

TSL 2

Gene SUMF2, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF2-218ENST00000529457 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 NDUFB10O96000 172 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 TSPY3P0CV98 308 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 TSPY8P0CW00 308 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 ITGB8P26012 769 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 TNFAIP2Q03169 654 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 HERVK_113Q902F9 699 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 HIPK3Q9H422 1215 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 COG6Q9Y2V7 657 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 Q9Y3F1 56 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 RLFQ13129 1914 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 A0A0C4DFX4 3053 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 BMP3P12645 472 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 ACTN1P12814 892 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 CSF2RAP15509 400 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 IGFBP4P22692 258 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 CDK7P50613 346 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 STAT2P52630 851 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 EPHB4P54760 987 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 TMEM240Q5SV17 173 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 PPM1EQ8WY54 764 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 ASB2Q96Q27 587 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 PBX4Q9BYU1 374 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 RAD50Q92878 1312 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 B4DLN1 442 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 ZNF365Q70YC5 407 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 PANK1Q8TE04 598 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 APPBP2Q92624 585 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 MKL1Q969V6 931 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-218ENST00000529457 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 COL9A1P20849 921 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 RASA1P20936 1047 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 SLC1A4P43007 532 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 NKX3-2P78367 333 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 RASIP1Q5U651 963 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 SLFN13Q68D06 897 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 TLK2Q86UE8 772 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 KIF28PB7ZC32 967 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 ERC2O15083 957 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 ITGA7Q13683 1181 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 ZBBXA8MT70 800 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 TMEM232C9JQI7 657 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 CPT1AP50416 773 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 EVX2Q03828 476 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 GMCL1Q96IK5 515 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 VTA1Q9NP79 307 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 RNF146Q9NTX7 359 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 RIPK3Q9Y572 518 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.62□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 KPNA6O60684 536 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 PLA2G6O60733 806 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 ACRP10323 421 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 RFC2P35250 354 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 RETREG2Q8NC44 543 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 CEP95Q96GE4 821 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 NAPBQ9H115 298 aa14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 MYADML2A6NDP7 307 aa14.6□□□□□ -0.07
SUMF2-218ENST00000529457 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms