RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518848.5

HOXA-AS3-201, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXA-AS3, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TFAP4Q01664 338 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PPARAQ07869 468 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TKFCQ3LXA3 575 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SPC25Q9HBM1 224 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MX1P20591 662 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GJA9P57773 515 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FAAP100Q0VG06 881 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KCNA10Q16322 511 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FSD1Q9BTV5 496 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ITGB8P26012 769 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FGD4Q96M96 766 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ACAD9Q9H845 621 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TMEM232C9JQI7 657 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC1A4P43007 532 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NOVP48745 357 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CDK7P50613 346 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FPGSQ05932 587 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ARMCX2Q7L311 632 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ASB14A6NK59 587 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TIMP1P01033 207 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC4A3P48751 1232 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KATNBL1Q9H079 304 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TBX21Q9UL17 535 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZNF536O15090 1300 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ASGR1P07306 291 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FGRP09769 529 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ALX1Q15699 326 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TSPY2A6NKD2 308 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ARVCFO00192 962 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MCCP23508 829 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GNASQ5JWF2 1037 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MFSD5Q6N075 450 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCDC174Q6PII3 467 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 EVI5LQ96CN4 794 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FAM161BQ96MY7 647 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 STX8Q9UNK0 236 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MCM3APO60318 1980 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FOXP2O15409 715 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ORC4O43929 436 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CABYRO75952 493 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 EPHB4P54760 987 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RNF146Q9NTX7 359 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 Q9Y3F1 56 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TTC28Q96AY4 2481 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MYADML2A6NDP7 307 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CTAGE5O15320 804 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ADCY6O43306 1168 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CNTN2Q02246 1040 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TNFAIP2Q03169 654 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DCAF4Q8WV16 495 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PNMA2Q9UL42 364 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms