RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 SMARCA1P28370 1054 aa17.84■□□□□ 0.45
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TRPS1-206ENST00000517323 USP17L13C9JLJ4 530 aa17.83■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 USP17L11C9JVI0 530 aa17.83■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 USP17L18D6R9N7 530 aa17.83■□□□□ 0.44
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TRPS1-206ENST00000517323 USP17L19D6RCP7 530 aa17.83■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 USP17L20D6RJB6 530 aa17.83■□□□□ 0.44
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TRPS1-206ENST00000517323 MS4A4AQ96JQ5 239 aa17.78■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 BRCA2P51587 3418 aa17.78■□□□□ 0.44
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TRPS1-206ENST00000517323 TMEM132BQ14DG7 1078 aa17.77■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 GPAT2Q6NUI2 795 aa17.77■□□□□ 0.44
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