RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.47□□□□□ -1.21
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LTKP29376 864 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASP7P55210 303 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFIXQ14938 502 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF385BQ569K4 471 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NLRX1Q86UT6 975 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS37DQ86XT2 251 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CXorf38Q8TB03 319 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCTN2Q96GX1 697 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR160Q9UJ42 338 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYN1P17600 705 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PI3P19957 117 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDE6BP35913 854 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHRNEQ04844 493 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCAF15Q66K64 600 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHST7Q9NS84 486 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR13Q9NZ81 148 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGRP09769 529 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTSKP43235 329 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPHB3P54753 998 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARID5AQ03989 594 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BBS9Q3SYG4 887 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GGNQ86UU5 652 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GMLQ99445 158 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GP6Q9HCN6 339 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBFA2T2O43439 604 aa7.42□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF445P59923 1031 aa7.42□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP2R5EQ16537 467 aa7.42□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNPTABQ3T906 1256 aa7.42□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.42□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.42□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM82A0PJX8 343 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYPP08247 313 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD247P20963 164 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ETFBP38117 255 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC7A5Q01650 507 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCFL5Q9UL49 500 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HRKO00198 91 aa7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RFXAPO00287 272 aa7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEIS1O00470 390 aa7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUSP4Q13115 394 aa7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HAUS7Q99871 368 aa7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.4□□□□□ -1.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR14I1A6ND48 311 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF205O95201 554 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VAV1P15498 845 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BMP8BP34820 402 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRF1Q5T601 910 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRF1Q92994 677 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A087WZG4 1122 aa7.38□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NRDCO43847 1150 aa7.38□□□□□ -1.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSNP06396 782 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms