RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489490.1

MAP4K4-215, Transcript of mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, human

TSL 3

Gene MAP4K4, Length 362 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAP4K4-215	ENST00000489490	OLFM4	Q6UX06	510 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	USP48	Q86UV5	1035 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	TDH	Q8IZJ6	230 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	FBXL18	Q96ME1	805 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	RNF208	Q9H0X6	261 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	AK5	Q9Y6K8	562 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MAP4K4-215	ENST00000489490	MAST4	O15021	2626 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	MEGF11	A6BM72	1044 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	FBXO24	O75426	580 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	USP17L7	P0C7H9	530 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	SYN1	P17600	705 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	BMP8B	P34820	402 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	RFC4	P35249	363 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	ITGAE	P38570	1179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	FGD1	P98174	961 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	POU4F3	Q15319	338 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	GPC2	Q8N158	579 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	FRMD6	Q96NE9	622 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	ASB2	Q96Q27	587 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	NUP155	O75694	1391 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	FZD9	O00144	591 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	DRD2	P14416	443 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	ITGB8	P26012	769 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	DAB2	P98082	770 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	PSMD2	Q13200	908 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	AP3B2	Q13367	1082 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	STK35	Q8TDR2	534 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	PPM1E	Q8WY54	764 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	CORO1B	Q9BR76	489 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	CEP41	Q9BYV8	373 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	COL4A5	P29400	1685 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	REV3L	O60673	3130 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	USP31	Q70CQ4	1352 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490		H0YIN7	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	SMIM22	K7EJ46	135 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	ENC1	O14682	589 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	TM4SF1	P30408	202 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	PREP	P48147	710 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	TMC4	Q7Z404	712 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	GIPC2	Q8TF65	315 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	SHTN1	A0MZ66	631 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	DYRK3	O43781	588 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	PAGE1	O75459	146 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	CTSH	P09668	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	FDX2	Q6P4F2	183 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	PDZD3	Q86UT5	571 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	PIGB	Q92521	554 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	CEP44	Q9C0F1	390 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	ZNF609	O15014	1411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	KIF1B	O60333	1816 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MAP4K4-215	ENST00000489490	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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