RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485556.5

STRC-211, Transcript of stereocilin, humanhuman

TSL 5

Gene STRC, Length 4,253 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRC-211ENST00000485556 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 VPS72Q15906 364 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 VWA3BQ502W6 1294 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 ERO1AQ96HE7 468 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 TIGD1Q96MW7 591 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 DESI2Q9BSY9 194 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 LY9Q9HBG7 655 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 GINS2Q9Y248 185 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 UTYO14607 1347 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 CCDC93Q567U6 631 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 MCTP2Q6DN12 878 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 PLA2G4DQ86XP0 818 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 JAKMIP2Q96AA8 810 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 SLFN14P0C7P3 912 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 CDC27P30260 824 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 PPP2R3AQ06190 1150 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 MIER3Q7Z3K6 550 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 EPSTI1Q96J88 318 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 CSADQ9Y600 493 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 MEGF6O75095 1541 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 SHTN1A0MZ66 631 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 ASIC2Q16515 512 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 RRAGAQ7L523 313 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 VTI1AQ96AJ9 217 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 TAF6LQ9Y6J9 622 aa11.09□□□□□ -0.63
STRC-211ENST00000485556 BMP3P12645 472 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 LMAN1P49257 510 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 UBXN2AP68543 259 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 PAGR1Q9BTK6 254 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 KRT5P13647 590 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 PTPN21Q16825 1174 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 LRRC8AQ8IWT6 810 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 TMEM47Q9BQJ4 181 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 FAM196BA6NMK8 535 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 TNFAIP3P21580 790 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 ACTN2P35609 894 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 TTLL6Q8N841 843 aa11.08□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 PSMB7Q99436 277 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 PANK4Q9NVE7 773 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 LAD1O00515 517 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 HSF2BPO75031 334 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 DNM2P50570 870 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 GPSM2P81274 684 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 STRN3Q13033 797 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 CYP2J2P51589 502 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 UBE2SQ16763 222 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 WDR44Q5JSH3 913 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 ARHGEF16Q5VV41 709 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa11.07□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 NTSR2O95665 410 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 MYZAPP0CAP1 466 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 IFT81Q8WYA0 676 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 AZI2Q9H6S1 392 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 CEP83Q9Y592 693 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 MST1RQ04912 1400 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 CRKP46108 304 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 PLCB3Q01970 1234 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 PODNQ7Z5L7 613 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.06□□□□□ -0.64
STRC-211ENST00000485556 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms