RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 KIFC2Q96AC6 838 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 SPC25Q9HBM1 224 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBED4O75132 1171 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 ACRP10323 421 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 CSF2RAP15509 400 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 PDE4AP27815 886 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 CDK7P50613 346 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM240Q5SV17 173 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC174Q6PII3 467 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 PBX4Q9BYU1 374 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 NYAP2Q9P242 653 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 COG6Q9Y2V7 657 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 GNASQ5JWF2 1037 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM199Q8N511 208 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 FGD4Q96M96 766 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-207ENST00000484547 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 ARVCFO00192 962 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 TNFRSF10AO00220 468 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP2A1O14983 1001 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 GJA9P57773 515 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 SBK1Q52WX2 424 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF365Q70YC5 407 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 ARMCX2Q7L311 632 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP2C18P33260 490 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 BEX3Q00994 111 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 RASIP1Q5U651 963 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM126BQ8IXS8 530 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 FBXO40Q9UH90 709 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 XIRP2A4UGR9 3374 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 PRDM1O75626 825 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CNTN2Q02246 1040 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CHST13Q8NET6 341 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CEP95Q96GE4 821 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 FEM1BQ9UK73 627 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CTAGE5O15320 804 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 GIMAP6Q6P9H5 292 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 EXOC6Q8TAG9 804 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 OSBP2Q969R2 916 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRCC1Q9C099 1032 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 KATNBL1Q9H079 304 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 IL23AQ9NPF7 189 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 MSRAQ9UJ68 235 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 COL9A1P20849 921 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 IGFBP4P22692 258 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 TDO2P48775 406 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 ADGRE1Q14246 886 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 AKNAD1Q5T1N1 836 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 MKL1Q969V6 931 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CHMP4CQ96CF2 233 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 MTMR4Q9NYA4 1195 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 THEGQ9P2T0 379 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 ASTN1O14525 1302 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 UMODL1Q5DID0 1318 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 TTLL1O95922 423 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 CD4P01730 458 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 APPP05067 770 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 OAZ1P54368 228 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 TNFAIP2Q03169 654 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 RAB30Q15771 203 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-207ENST00000484547 SLFN13Q68D06 897 aa13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms