RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484134.5

RPUSD3-216, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 2,491 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-216ENST00000484134 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.09■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.09■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.09■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.09■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 EBAG9O00559 213 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 KLRC4O43908 158 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 SH3GL2Q99962 352 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 PP2D1A8MPX8 630 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 ERLIN2O94905 339 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 STAT6P42226 847 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 DNM2P50570 870 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 SLC7A5Q01650 507 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 TTI2Q6NXR4 508 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 TRIM47Q96LD4 638 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 THAP9Q9H5L6 903 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 SNX12Q9UMY4 172 aa22.08■■□□□ 1.13
RPUSD3-216ENST00000484134 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 CYP7A1P22680 504 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 GNGT1P63211 74 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 ARL8AQ96BM9 186 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 MYH10P35580 1976 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 PLIN2Q99541 437 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 DEF6Q9H4E7 631 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 NLRP5P59047 1200 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 EVX2Q03828 476 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 LRRC15Q8TF66 581 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 FAM107BQ9H098 131 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 EXOC1Q9NV70 894 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 SAMM50Q9Y512 469 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 ZBED6P86452 979 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 TTMPQ5BVD1 217 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 DISC1Q9NRI5 854 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 EHD2Q9NZN4 543 aa22.06■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 VAV2P52735 878 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 NMT2O60551 498 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 TRAPPC10P48553 1259 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 KIF5AQ12840 1032 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 MCTP2Q6DN12 878 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 STARD3NLO95772 234 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 SCG2P13521 617 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 CXCR5P32302 372 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 PIGBQ92521 554 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 PSMB7Q99436 277 aa22.04■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 KCNB1Q14721 858 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 IQCEQ6IPM2 695 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 PSMA7O14818 248 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 RHOBTB3O94955 611 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 MOCS3O95396 460 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 IL2RBP14784 551 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 CCDC96Q2M329 555 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 MIIPQ5JXC2 388 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD3-216ENST00000484134 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.03■■□□□ 1.12
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