RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.61□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.61□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 XAGE2Q96GT9 111 aa9.61□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.61□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 COPRSQ9NQ92 184 aa9.61□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.61□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 CCER2I3L3R5 266 aa9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 CRBNQ96SW2 442 aa9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 TECTAO75443 2155 aa9.6□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 ZEB2O60315 1214 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 GJA9P57773 515 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 ITGA7Q13683 1181 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 BANK1Q8NDB2 785 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 SCLYQ96I15 445 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 RAD9AQ99638 391 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 DLL3Q9NYJ7 618 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 FBXO3Q9UK99 471 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.59□□□□□ -0.87
SZRD1-208ENST00000476423 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 SRGAP3O43295 1099 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 MBTPS2O43462 519 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 ARHGEF15O94989 841 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 VCAM1P19320 739 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 MCAMP43121 646 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 GSTO1P78417 241 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 PLS1Q14651 629 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 RETREG2Q8NC44 543 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 SAMD11Q96NU1 681 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 MMP19Q99542 508 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 CLDND1Q9NY35 253 aa9.58□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 GDF11O95390 407 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 COL19A1Q14993 1142 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 TEX11Q8IYF3 940 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 SPATA5Q8NB90 893 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 SNRKQ9NRH2 765 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.57□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 FLT1P17948 1338 aa9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 MYH1P12882 1939 aa9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 COPB2P35606 906 aa9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 NKX3-2P78367 333 aa9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 MTX1Q13505 466 aa9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 NEUROD6Q96NK8 337 aa9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 RAI14Q9P0K7 980 aa9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 FAM186AA6NE01 2351 aa9.56□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 MYADML2A6NDP7 307 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 B4GALT4O60513 344 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 HLA-DOAP06340 250 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 EVX2Q03828 476 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 VWCEQ96DN2 955 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 ASIC4Q96FT7 647 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms