RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 RTN1Q16799 776 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 FANCBQ8NB91 859 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 PORCNQ9H237 461 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO40Q9UH90 709 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 ICAM1P05362 532 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 ERCC3P19447 782 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 RXRAP19793 462 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 TRAF1Q13077 416 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 TKFCQ3LXA3 575 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 GPR142Q7Z601 462 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 NEK4P51957 841 aa25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 SRRDQ9UH36 339 aa25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1-212ENST00000472427 STRNO43815 780 aa25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 SMARCA1P28370 1054 aa25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 SNAP25P60880 206 aa25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 CHST13Q8NET6 341 aa25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 CPVLQ9H3G5 476 aa25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 FCER1AP12319 257 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ALAS1P13196 640 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 KCTD2Q14681 263 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 IL27Q8NEV9 243 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 RAET1EQ8TD07 263 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 CTGFP29279 349 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 HOMER1Q86YM7 354 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 MMP19Q99542 508 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ACAD9Q9H845 621 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF146Q9NTX7 359 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF536O15090 1300 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ZBTB5O15062 677 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 PTPREP23469 700 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 RGS2P41220 211 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 EVCP57679 992 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 PRKCZQ05513 592 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 RABEP1Q15276 862 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO11Q86XK2 927 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 PLXNB2O15031 1838 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 NID2Q14112 1375 aa25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 AK2P54819 239 aa25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 AMNQ9BXJ7 453 aa25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCB11O95342 1321 aa25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 FLT3LGP49771 235 aa25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 GRB14Q14449 540 aa25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 USH1GQ495M9 461 aa25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 DDX11Q96FC9 970 aa25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-212ENST00000472427 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 ST18O60284 1047 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 MAP2K5Q13163 448 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 IRF5Q13568 498 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 DPP9Q86TI2 863 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 MTMR8Q96EF0 704 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 PIGSQ96S52 555 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 APBA2Q99767 749 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 RIPK3Q9Y572 518 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 PFASO15067 1338 aa25.19■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 CPLX1O14810 134 aa25.19■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 ADORA2AP29274 412 aa25.19■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 CAP1Q01518 475 aa25.19■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 MORN1Q5T089 497 aa25.19■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.19■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RALGPS1-212ENST00000472427 GABRQQ9UN88 632 aa25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms