RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471409.1

USP9Y-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 Y-linked, human

TSL 2

Gene USP9Y, Length 2,410 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP9Y-204	ENST00000471409	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409		K7ESF4	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	AGRP	O00253	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ASGR2	P07307	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	MYBL2	P10244	700 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	PYGM	P11217	842 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ODF1	Q14990	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	TIMM44	O43615	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ZEB2	O60315	1214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	MT-CO1	P00395	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	NFKB1	P19838	968 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CHRNA4	P43681	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	INPP5A	Q14642	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	KCTD2	Q14681	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409		A0A087WZG4	1122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	BLACE	A4D250	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	MSTN	O14793	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	PDILT	Q8N807	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409		A6NNZ2	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	GNB5	O14775	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	COPB2	P35606	906 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	IGFALS	P35858	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	STK3	Q13188	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	IGHA1	P01876	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	EPHX1	P07099	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	GJA9	P57773	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	PLAUR	Q03405	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9Y-204	ENST00000471409	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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