RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468747.5

FAM107B-211, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM107B, Length 2,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM107B-211ENST00000468747 CAPZA3Q96KX2 299 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 MED4Q9NPJ6 270 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 IL17AQ16552 155 aa25.12■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 ADAMTS3O15072 1205 aa25.12■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 TNFRSF25Q93038 417 aa25.12■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.11■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 XBP1P17861 261 aa25.11■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 HERVK_113P62684 666 aa25.11■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.11■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.11■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.11■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 HPCAL4Q9UM19 191 aa25.11■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 PSMD14O00487 310 aa25.1■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.1■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 TUBBP07437 444 aa25.1■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 PRCPP42785 496 aa25.1■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 RCAN1P53805 252 aa25.1■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 MYBL2P10244 700 aa25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 NFIXQ14938 502 aa25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 WDR59Q6PJI9 974 aa25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 HINFPQ9BQA5 517 aa25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 MYH6P13533 1939 aa25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 FGRP09769 529 aa25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 TRIM14Q14142 442 aa25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 PACS2Q86VP3 889 aa25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.09■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 SPAG1Q07617 926 aa25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 SAR1BQ9Y6B6 198 aa25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 CYP2D6P10635 497 aa25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.08■■□□□ 1.61
FAM107B-211ENST00000468747 NHSQ6T4R5 1651 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 MCM7P33993 719 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 VIPAS39Q9H9C1 493 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 RCCD1A6NED2 376 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF185O15231 689 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 RPN1P04843 607 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 IQCA1Q86XH1 822 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 HAUS4Q9H6D7 363 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 MAGEA9P43362 315 aa25.06■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 MB21D1Q8N884 522 aa25.06■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 EFCC1Q9HA90 598 aa25.06■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.06■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 NMT2O60551 498 aa25.06■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 BMP15O95972 392 aa25.06■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 GGCXP38435 758 aa25.06■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.06■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 CERS3Q8IU89 383 aa25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 COG1Q8WTW3 980 aa25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 DNAJC7Q99615 494 aa25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 TROAPQ12815 778 aa25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.05■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 CORO7P57737 925 aa25.04■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 STIM1Q13586 685 aa25.04■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 GRAPQ13588 217 aa25.04■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.04■■□□□ 1.6
FAM107B-211ENST00000468747 CNBD1Q8NA66 436 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms