RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 LBX1P52954 281 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 RCAN1P53805 252 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CCNA1P78396 465 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ME3Q16798 604 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 WDR78Q5VTH9 848 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 HOMER1Q86YM7 354 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 NECAB1Q8N987 351 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 AGBL1Q96MI9 1066 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 PIGSQ96S52 555 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 LZTS2Q9BRK4 669 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 TEX13BQ9BXU2 312 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 PORCNQ9H237 461 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 EFCC1Q9HA90 598 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 HOMER2Q9NSB8 354 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF536O15090 1300 aa10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ICAM1P05362 532 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ERCC3P19447 782 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 PSMC4P43686 418 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 OAZ1P54368 228 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 SCRN1Q12765 414 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 KIF22Q14807 665 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 PPP2R5BQ15173 497 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 QRICH1Q2TAL8 776 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 USH1GQ495M9 461 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 NCAPG2Q86XI2 1143 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 SPZ1Q9BXG8 430 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 RIOX1Q9H6W3 641 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CCPG1Q9ULG6 757 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 RIPK3Q9Y572 518 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 NID2Q14112 1375 aa10.25□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CPLX1O14810 134 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ATP2A1O14983 1001 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ZBTB5O15062 677 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 PFKFB2O60825 505 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 DTNBO60941 627 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ALAS1P13196 640 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 SMARCA1P28370 1054 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CTGFP29279 349 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 MAPK4P31152 587 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CAP1Q01518 475 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 FUT2Q10981 343 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 RIOX2Q8IUF8 465 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 PHKBQ93100 1093 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 MTMR8Q96EF0 704 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ERO1AQ96HE7 468 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM47Q96LD4 638 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa10.24□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 SLC25A27O95847 323 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 FCGRTP55899 365 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 NTRK3Q16288 839 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 GPR142Q7Z601 462 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 FBXO11Q86XK2 927 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 SHCBP1Q8NEM2 672 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 GTF3C6Q969F1 213 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 AMNQ9BXJ7 453 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 SLC26A6Q9BXS9 759 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 MROH8Q9H579 483 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 RNF146Q9NTX7 359 aa10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 IFNAR1P17181 557 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 COPB2P35606 906 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 TKFCQ3LXA3 575 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 MUM1L1Q5H9M0 696 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 IL27Q8NEV9 243 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 COA7Q96BR5 231 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 ACAD9Q9H845 621 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.22□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 NFIBO00712 420 aa10.21□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 CDKL5O76039 1030 aa10.21□□□□□ -0.77
CASQ1-202ENST00000467691 FCER1AP12319 257 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms