RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464752.1

SRRM3-201, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 3, humanhuman

TSL 2

Gene SRRM3, Length 2,797 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3-201ENST00000464752 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 KLRF2D3W0D1 207 aa23■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 MB21D1Q8N884 522 aa23■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 TRIM47Q96LD4 638 aa23■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 PNKPQ96T60 521 aa23■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 LETM2Q2VYF4 491 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 RASA1P20936 1047 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 GNAQP50148 359 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 PLCG1P19174 1290 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 CEP112Q8N8E3 955 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 ATP8B1O43520 1251 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 NDUFA10O95299 355 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 TXNRD1Q16881 649 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 LGALS16A8MUM7 142 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 B4DLN1 442 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 BAG3O95817 575 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 KLK7P49862 253 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 NAPAP54920 295 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 TRIM14Q14142 442 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 GYS2P54840 703 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 PSMA7O14818 248 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 RHOBTB3O94955 611 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 KCNB1Q14721 858 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 TTI2Q6NXR4 508 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 HPS3Q969F9 1004 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 CCDC151A5D8V7 595 aa22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 ENC1O14682 589 aa22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 ST5P78524 1137 aa22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 WDR59Q6PJI9 974 aa22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 CABP7Q86V35 215 aa22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
SRRM3-201ENST00000464752 TECP42680 631 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 STK4Q13043 487 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 SMCO2A6NFE2 343 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 FCER1AP12319 257 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 CYP2C19P33261 490 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 STIM1Q13586 685 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 EYA3Q99504 573 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 FLT1P17948 1338 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 BTDP43251 543 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 CDK8P49336 464 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 MCM6Q14566 821 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 PIP4K2BP78356 416 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 PDE4DQ08499 809 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 BRD3Q15059 726 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 THAP9Q9H5L6 903 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 OR52Z1P0C646 297 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 PPP4CP60510 307 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 ASIC1P78348 528 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 GSTO1P78417 241 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 GRAPQ13588 217 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRM3-201ENST00000464752 GALNT17Q6IS24 598 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms