RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-208	ENST00000462335	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335		B4DLN1	442 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ATP2A1	O14983	1001 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	DDAH1	O94760	285 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	INHA	P05111	366 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ICAM1	P05362	532 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	LIFR	P42702	1097 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	SEC23A	Q15436	765 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	USH1G	Q495M9	461 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	NSMF	Q6X4W1	530 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	GJD2	Q9UKL4	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ZBTB43	O43298	467 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CCL5	P13501	91 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	SOX10	P56693	466 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CAP1	Q01518	475 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	GRB14	Q14449	540 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	MORN1	Q5T089	497 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	FBXO11	Q86XK2	927 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ARMC5	Q96C12	935 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	LY9	Q9HBG7	655 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	PFAS	O15067	1338 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	PGK2	P07205	417 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	SNHG28	P0DPA3	235 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ANTXR2	P58335	489 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	GRM4	Q14833	912 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335		Q6ZUG5	572 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	MICU3	Q86XE3	530 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	MAP3K14	Q99558	947 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	AMN	Q9BXJ7	453 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	RIPK3	Q9Y572	518 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ABCB11	O95342	1321 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	RTN1	Q16799	776 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	FANCB	Q8NB91	859 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	MYL10	Q9BUA6	226 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	ASB14	A6NK59	587 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	HOXC6	P09630	235 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CPA1	P15085	419 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CAPN2	P17655	700 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CALML3	P27482	149 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	TROAP	Q12815	778 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKP4-208	ENST00000462335	CCL14	Q16627	93 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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