RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 GINM1Q9NU53 330 aa6.06□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 PRKCAP17252 672 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 VIPR1P32241 457 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 ZNF445P59923 1031 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 ERVFRD-1P60508 538 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 NAT16Q8N8M0 369 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 NUP43Q8NFH3 380 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 GP6Q9HCN6 339 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 A0A1W2PQY0 241 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 HRKO00198 91 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 CD247P20963 164 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 ARL4AP40617 200 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 SSPNQ14714 243 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 FIBCD1Q8N539 461 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 JMJD8Q96S16 334 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 KCTD3Q9Y597 815 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 MPOP05164 745 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 ITGA4P13612 1032 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 EPHB3P54753 998 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 CYP4F8P98187 520 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 LAPTM5Q13571 262 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 GPRASP2Q96D09 838 aa6.03□□□□□ -1.44
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TTC3-211ENST00000460328 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC3-211ENST00000460328 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.03□□□□□ -1.44
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TTC3-211ENST00000460328 PI3P19957 117 aa6.02□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 SOX9P48436 509 aa6.02□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.02□□□□□ -1.45
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TTC3-211ENST00000460328 HOMEZQ8IX15 550 aa6.02□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
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TTC3-211ENST00000460328 CDR1P51861 262 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 ZNF385BQ569K4 471 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 LILRA6Q6PI73 481 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 TMC6Q7Z403 805 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 SPATA32Q96LK8 384 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
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TTC3-211ENST00000460328 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 IRAK3Q9Y616 596 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.01□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 A0A1W2PQ27 194 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 A0A1W2PQ64 194 aa6□□□□□ -1.45
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TTC3-211ENST00000460328 A0A1W2PQD8 194 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 N4BP3O15049 544 aa6□□□□□ -1.45
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TTC3-211ENST00000460328 GIPRP48546 466 aa6□□□□□ -1.45
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TTC3-211ENST00000460328 MVKQ03426 396 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 PPP2R5DQ14738 602 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 TCEAL1Q15170 157 aa6□□□□□ -1.45
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TTC3-211ENST00000460328 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 JAMLQ86YT9 394 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 PANK1Q8TE04 598 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 HAUS7Q99871 368 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6□□□□□ -1.45
TTC3-211ENST00000460328 PCDHB10Q9UN67 800 aa6□□□□□ -1.45
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