RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.83□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GMIPQ9P107 970 aa10.83□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.83□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.83□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLAAQ9Y263 795 aa10.83□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TACC3Q9Y6A5 838 aa10.83□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUP188Q5SRE5 1749 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UPK3BL1B0FP48 263 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UPK3BL2E5RIL1 263 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR25O00155 361 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP11A1P05108 521 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VIL1P09327 827 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDK8P49336 464 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MCM10Q7L590 875 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCAF5Q96JK2 942 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHF1Q96S99 279 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RREB1Q92766 1687 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP3K5Q99683 1374 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLSCR1O15162 318 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNMTO43148 476 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASMTLO95671 621 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADH6P28332 368 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSTM4Q03013 218 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LONRF2Q1L5Z9 754 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC181Q5TID7 509 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HGSNATQ68CP4 663 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HDXQ7Z353 690 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATG3Q9NT62 314 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PALLDQ8WX93 1383 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNAT3A8MTJ3 354 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ST8SIA5O15466 376 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARAFP10398 606 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARL4DP49703 201 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC39A6Q13433 755 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM67Q5HYA8 995 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL17REQ8NFR9 667 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WNT8BQ93098 351 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLPPR2Q96GM1 343 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MDFIQ99750 246 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CORO1BQ9BR76 489 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 REV1Q9UBZ9 1251 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCN11AQ9UI33 1791 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC14CA4D256 554 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NME1P15531 152 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDE4BQ07343 736 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C19orf57Q0VDD7 668 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF827Q17R98 1081 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OVOS1Q6IE37 1185 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRFN4Q6PJG9 635 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VHLLQ6RSH7 139 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNC5AQ6ZN44 842 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM5Q71RC9 77 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRT26Q7Z3Y9 468 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATG4CQ96DT6 458 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPN3Q9H201 632 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLF15Q9UIH9 416 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CORINQ9Y5Q5 1042 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC22A31A6NKX4 558 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNFRSF10CO14798 259 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INPP5AQ14642 412 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POU4F3Q15319 338 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SV2AQ7L0J3 742 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NLRC3Q7RTR2 1065 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA9Q9BWV2 254 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD2APQ9Y5K6 639 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.77□□□□□ -0.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IQCA1LA6NCM1 817 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNQ3O43525 872 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GFRA3O60609 400 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NEFMP07197 916 aa10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms