RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445998.1

UBQLN3-202, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene UBQLN3, Length 817 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBQLN3-202ENST00000445998 CTGFP29279 349 aa15.93■□□□□ 0.14
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UBQLN3-202ENST00000445998 RGS2P41220 211 aa15.93■□□□□ 0.14
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UBQLN3-202ENST00000445998 DPP9Q86TI2 863 aa15.93■□□□□ 0.14
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