RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GABBR1Q9UBS5 961 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RLFQ13129 1914 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCP10L2B9ZVM9 353 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCER2I3L3R5 266 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNAP23O00161 211 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYO1BO43795 1136 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM13AO94988 1023 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMP14P50281 582 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPIL2Q13356 520 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBCELQ5QJ74 424 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C16orf46Q6P387 395 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERO1BQ86YB8 467 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WRNIP1Q96S55 665 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DOCK2Q92608 1830 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GBF1Q92538 1859 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANP32CO43423 234 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IL2RAP01589 272 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CACNB3P54284 484 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DOCK1Q14185 1865 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDK2AP1O14519 115 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDE8AO60658 829 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MPSTP25325 297 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INPP5BP32019 993 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCEAL1Q15170 157 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SHHQ15465 462 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RINLQ6ZS11 566 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIF1Q9H611 641 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GREM2Q9H772 168 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SENP2Q9HC62 589 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD209Q9NNX6 404 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LOC285556D6RIA3 1793 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF4AO95239 1232 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADH1AP07327 375 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL6A1P12109 1028 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIMP2P16035 220 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CTSWP56202 376 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RHBDL3P58872 404 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRIN2CQ14957 1233 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL19A1Q14993 1142 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COX20Q5RI15 118 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPM1EQ8WY54 764 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIFC2Q96AC6 838 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TINF2Q9BSI4 451 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AAASQ9NRG9 546 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP3Q9Y6I4 520 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNFRSF10BO14763 440 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HMGCRP04035 888 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP2B1P20020 1258 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBX4P57082 545 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms