RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	GUCY2C	P25092	1073 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.95	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	SPATA32	Q96LK8	384 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	VIPR1	P32241	457 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	ERVFRD-1	P60508	538 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	TCEAL1	Q15170	157 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	EFEMP2	O95967	443 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	ITGA4	P13612	1032 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	DCAF15	Q66K64	600 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	LILRA6	Q6PI73	481 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	BRF1	Q92994	677 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	GP6	Q9HCN6	339 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	GCM1	Q9NP62	436 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	NUDT19	A8MXV4	375 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	INHBB	P09529	407 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	TMC6	Q7Z403	805 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283		H0Y8X5	98 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	N4BP3	O15049	544 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	PI3	P19957	117 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	CD247	P20963	164 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	POU4F1	Q01851	419 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	PAK2	Q13177	524 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	FIBCD1	Q8N539	461 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	SHOX	O15266	292 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	BMP7	P18075	431 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	VAMP1	P23763	118 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF445	P59923	1031 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	SSPN	Q14714	243 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	KIR3DS1	Q14943	382 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	RTP2	Q5QGT7	225 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	JMJD8	Q96S16	334 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPN4-204	ENST00000431283	TBC1D8	O95759	1140 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	CD3E	P07766	207 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	MZB1	Q8WU39	189 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	GBP3	Q9H0R5	595 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	GINM1	Q9NU53	330 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	RECK	O95980	971 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	EPHB3	P54753	998 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	CTSW	P56202	376 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	NR1I3	Q14994	352 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	GPRASP2	Q96D09	838 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A087WZG4	1122 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	PPP2R5D	Q14738	602 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	LCE4A	Q5TA78	99 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	WHRN	Q9P202	907 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	PPM1B	O75688	479 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	CDR1	P51861	262 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC7A5	Q01650	507 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	PPP2R5E	Q16537	467 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
PTPN4-204	ENST00000431283	LDHD	Q86WU2	507 aa		7.86	□□□□□ -1.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms