RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1QTNF9P0C862 333 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NKX3-2P78367 333 aa10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRBNQ96SW2 442 aa10.85□□□□□ -0.67
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAM15Q13444 863 aa10.84□□□□□ -0.67
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa10.83□□□□□ -0.68
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MBIPQ9NS73 344 aa10.83□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SORCS3Q9UPU3 1222 aa10.83□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPN13Q12923 2485 aa10.83□□□□□ -0.68
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BRD1O95696 1058 aa10.82□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.82□□□□□ -0.68
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNNM1Q9NRU3 951 aa10.82□□□□□ -0.68
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GINM1Q9NU53 330 aa10.82□□□□□ -0.68
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.81□□□□□ -0.68
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRDX5P30044 214 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BORCS6Q96GS4 357 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEFF1Q8IYR6 380 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUSD6Q92537 303 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLEKHF1Q96S99 279 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGFLR1Q9H665 355 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIPA1L1O43166 1804 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MICAL3Q7RTP6 2002 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPR3P17342 541 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
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