RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 CRKP46108 304 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 AKNAQ7Z591 1439 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 TCFL5Q9UL49 500 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 NUAK1O60285 661 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 DLG4P78352 724 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 ATG4CQ96DT6 458 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 MAP6Q96JE9 813 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 NOTOA8MTQ0 251 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 NRDCO43847 1150 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 CLEC3AO75596 197 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 SEZ6Q53EL9 994 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 NLRX1Q86UT6 975 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 GIPC2Q8TF65 315 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 FMN1Q68DA7 1419 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 ATP10BO94823 1461 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM82A0PJX8 343 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 SIGLEC6O43699 453 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF165P49910 485 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 CLCQ05315 142 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 APOBRQ0VD83 1088 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 UBP1Q9NZI7 540 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.46□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.46□□□□□ -1.05
C9orf3-205ENST00000427193 OR14I1A6ND48 311 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 PRAMEF1O95521 474 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 HSPA1LP34931 641 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 SLC14A2Q15849 920 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 BBS9Q3SYG4 887 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 GK5Q6ZS86 529 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 RICTORQ6R327 1708 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 HRKO00198 91 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 TNFRSF10CO14798 259 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 SYPP08247 313 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 MCM4P33991 863 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 GALK1P51570 392 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 NCOA1Q15788 1441 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 MAP3K1Q13233 1512 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 ADGRF1Q5T601 910 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 LILRA6Q6PI73 481 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 NKD1Q969G9 470 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 GCM1Q9NP62 436 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 CHST7Q9NS84 486 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 FKTNO75072 461 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 EFEMP2O95967 443 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM192Q8IY95 271 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 SLC6A18Q96N87 628 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 PRR13Q9NZ81 148 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-205ENST00000427193 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms