RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZBTB8AQ96BR9 441 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLPPR2Q96GM1 343 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PTGFRNQ9P2B2 879 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TJP2Q9UDY2 1190 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TCFL5Q9UL49 500 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRAK1Q9UPV9 953 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLSCR1O15162 318 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SRGAP3O43295 1099 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FKTNO75072 461 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CYBBP04839 570 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DBHP09172 617 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRT4P19013 534 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPL13P26373 211 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GRK4P32298 578 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPP2CBP62714 309 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPP2CAP67775 309 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRR5P85299 388 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAPK7Q13164 816 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BBS9Q3SYG4 887 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDCA8Q53HL2 280 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RASIP1Q5U651 963 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FNDC7Q5VTL7 733 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SCARA3Q6AZY7 606 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LLGL2Q6P1M3 1020 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LINC00482Q8N8I6 264 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C9orf106Q8NAJ2 232 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 STK32AQ8WU08 396 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNF141Q8WVD5 230 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EXTL1Q92935 676 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DDX11Q96FC9 970 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PTPN18Q99952 460 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MMRN2Q9H8L6 949 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IMPACTQ9P2X3 320 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A1W2PQY0 241 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C9orf118A6NHY6 69 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PAGE1O75459 146 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C1SP09871 688 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NPR3P17342 541 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PMLP29590 882 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 THBS2P35442 1172 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDK8P49336 464 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LRRC14Q15048 493 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HS1BP3Q53T59 392 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLFN13Q68D06 897 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC6A19Q695T7 634 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SYCE2Q6PIF2 218 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 Q6ZPA2 131 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRIMA1Q86XR5 153 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LINC00116Q8NCU8 138 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC74AQ96AQ1 378 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TCTN2Q96GX1 697 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMEM87BQ96K49 555 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADOQ96SZ5 270 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRRX2Q99811 253 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HDAC8Q9BY41 377 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MEGF9Q9H1U4 602 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 JADE2Q9NQC1 790 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC87Q9NVE4 849 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SAMM50Q9Y512 469 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 F8W031 263 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ENC1O14682 589 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FOXN1O15353 648 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NUDT3O95989 172 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NEFLP07196 543 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SYPP08247 313 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRT10P13645 584 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAKP20794 623 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ORC1Q13415 861 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MTMR3Q13615 1198 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CFAP70Q5T0N1 1121 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GAREM2Q75VX8 874 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ULK2Q8IYT8 1036 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DAGLBQ8NCG7 672 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms