RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 ZBED4O75132 1171 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 CYP2C18P33260 490 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 GJA9P57773 515 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 BEX3Q00994 111 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 RASIP1Q5U651 963 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 ARMCX2Q7L311 632 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 FAM126BQ8IXS8 530 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 KATNBL1Q9H079 304 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 PRDM12Q9H4Q4 367 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 HOMER2Q9NSB8 354 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.04■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 ASTN1O14525 1302 aa16.03■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.03■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 TSHZ3Q63HK5 1081 aa16.03■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.03■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.03■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 CEP95Q96GE4 821 aa16.03■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 GBF1Q92538 1859 aa16.03■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 CD4P01730 458 aa16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 ADGRE1Q14246 886 aa16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 MKL1Q969V6 931 aa16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 FEM1BQ9UK73 627 aa16.02■□□□□ 0.16
TTPAL-203ENST00000372906 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 MS4A1P11836 297 aa16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM199Q8N511 208 aa16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 CHST13Q8NET6 341 aa16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 SPC25Q9HBM1 224 aa16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 GRIN2DO15399 1336 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 M0R2C6 588 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 TNFRSF10AO00220 468 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 GPAA1O43292 621 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 SLFN13Q68D06 897 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 CXCL17Q6UXB2 119 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 FAM133AQ8N9E0 248 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 KBTBD3Q8NAB2 608 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 AGBL1Q96MI9 1066 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF536O15090 1300 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM232C9JQI7 657 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 APPP05067 770 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 TDO2P48775 406 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 SNAP25P60880 206 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 NKX3-2P78367 333 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 TNFAIP2Q03169 654 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 HERVK_113Q902F9 699 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 APPBP2Q92624 585 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 IL23AQ9NPF7 189 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 FBXO40Q9UH90 709 aa15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 TTLL1O95922 423 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 BMP3P12645 472 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 COL9A1P20849 921 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 IGFBP4P22692 258 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 OAZ1P54368 228 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 CCL23P55773 120 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC174Q6PII3 467 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TTPAL-203ENST00000372906 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms