RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ZBED4O75132 1171 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PPFIA1Q13136 1202 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 DESI2Q9BSY9 194 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TRIM4Q9C037 500 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ATP2A1O14983 1001 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SERPINB2P05120 415 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 KRT5P13647 590 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 ICA1Q05084 483 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 GPBP1Q86WP2 473 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 TPH2Q8IWU9 490 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 KIFAP3Q92845 792 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 AIFM3Q96NN9 605 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PALLDQ8WX93 1383 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 GAS7O60861 476 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 BBOX1O75936 387 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SNCBQ16143 134 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PRR16Q569H4 304 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SPOPO43791 374 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 DPH6Q7L8W6 267 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 TLDC2A0PJX2 215 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 CALCOCO2Q13137 446 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 A0A087WWV3 80 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 MXRA7P84157 204 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SLFN13Q68D06 897 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SYNE4Q8N205 404 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 HOOK2Q96ED9 719 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 MED4Q9NPJ6 270 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 FLOT1O75955 427 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 GNA14O95837 355 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 MAP7Q14244 749 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC17Q96LX7 622 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 IKBKBO14920 756 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 ZBTB22O15209 634 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 FBXO11Q86XK2 927 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PPP1R7Q15435 360 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PSMB7Q99436 277 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 TRIM7Q9C029 511 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SUFUQ9UMX1 484 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 LRRD1A4D1F6 860 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SNAP23O00161 211 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 PFDN1O60925 122 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC25Q86WR0 208 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 CNKSR1Q969H4 720 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 TMC4Q7Z404 712 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 FAM71BQ8TC56 605 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 SH3GL3Q99963 347 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-204ENST00000368210 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms