RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.14■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 BARHL2Q9NY43 387 aa24.14■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 MYO6Q9UM54 1294 aa24.14■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 PP2D1A8MPX8 630 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 BARGINQ6ZT62 677 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC7Q99615 494 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 CUEDC2Q9H467 287 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 KLRC4O43908 158 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 PNKPQ96T60 521 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 DNM2P50570 870 aa24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 TXLNBQ8N3L3 684 aa24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 GBP3Q9H0R5 595 aa24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 USP17L3A6NCW0 530 aa24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 USP17L4A6NCW7 530 aa24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 STXBP3O00186 592 aa24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 BAG3O95817 575 aa24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 NARFQ9UHQ1 456 aa24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 AK8Q96MA6 479 aa24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 PLIN2Q99541 437 aa24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 CYTH3O43739 400 aa24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 RHOXF2BP0C7M4 288 aa24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 GSTO1P78417 241 aa24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 AMPD2Q01433 879 aa24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT83P78385 493 aa24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 TTI2Q6NXR4 508 aa24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 NUP58Q9BVL2 599 aa24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 STX8Q9UNK0 236 aa24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNQ4P56696 695 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 MCM6Q14566 821 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 ABCB6Q9NP58 842 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 L1RE1Q9UN81 338 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 TAF1P21675 1872 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 BICDL2A1A5D9 508 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 PSMD14O00487 310 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 EXOC1Q9NV70 894 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 LAMB1P07942 1786 aa24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 ZPR1O75312 459 aa24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 SRGNP10124 158 aa24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 ST5P78524 1137 aa24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 CABP7Q86V35 215 aa24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 RETREG2Q8NC44 543 aa24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 MTMR7Q9Y216 660 aa24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.08■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP1R2P41236 205 aa24.08■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.08■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.08■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.08■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 B4DLN1 442 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 OR52Z1P0C646 297 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR59Q6PJI9 974 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 SMIM5Q71RC9 77 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 PLCG1P19174 1290 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 CCNE1P24864 410 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP4CP60510 307 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 VSNL1P62760 191 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 MEA1Q16626 185 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 P2RX5Q93086 422 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 EXOC4Q96A65 974 aa24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms