RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMX2Q9Y320 296 aa24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAP2P40123 477 aa24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASA3Q14644 834 aa24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SBF1O95248 1867 aa24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.89■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BMP3P12645 472 aa24.89■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP49Q70CQ1 688 aa24.89■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEPSINQ96N21 525 aa24.89■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.89■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAD21O60216 631 aa24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KANK3Q6NY19 840 aa24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEK8Q86SG6 692 aa24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LUZP1Q86V48 1076 aa24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP25Q9UHP3 1055 aa24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRPHP41219 470 aa24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.88■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQCB1Q15051 598 aa24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL17AQ16552 155 aa24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CUL5Q93034 780 aa24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPSTI1Q96J88 318 aa24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOPCQ9HD26 462 aa24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASNSP08243 561 aa24.86■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.86■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.86■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH2D4AQ9H788 454 aa24.86■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMNB1P20700 586 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ECE1P42892 770 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRP12P59046 1061 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACER1Q8TDN7 264 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBCKQ8TEA7 893 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GINM1Q9NU53 330 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNOCQ13519 176 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.85■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A087X0B3 334 aa24.84■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM232C9JQI7 657 aa24.84■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POSTNQ15063 836 aa24.84■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HS1BP3Q53T59 392 aa24.84■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.84■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.84■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM260Q9NX78 707 aa24.84■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HACL1Q9UJ83 578 aa24.84■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.84■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLFN14P0C7P3 912 aa24.83■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.83■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDILTQ8N807 584 aa24.83■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMNQ9BXJ7 453 aa24.83■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.83■■□□□ 1.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.83■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADCY5O95622 1261 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LETM2Q2VYF4 491 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPCR1Q3MIW9 517 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPC2Q8N158 579 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VCPKMTQ9H867 229 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A087WWV3 80 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H7C1D1 291 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEMFO60524 1076 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLA2G6O60733 806 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAT2P52630 851 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AP5Z1O43299 807 aa24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR52Z1P0C646 297 aa24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms