RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.98■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 VWA5AO00534 786 aa22.97■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 BRD1O95696 1058 aa22.97■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 GUCY1B3Q02153 619 aa22.97■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 REPS2Q8NFH8 660 aa22.97■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 CCDC102AQ96A19 550 aa22.97■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.97■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.97■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 BTBD19C9JJ37 291 aa22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 NPY5RQ15761 445 aa22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 COA7Q96BR5 231 aa22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 PARP14Q460N5 1801 aa22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.96■■□□□ 1.27
PPARG-202ENST00000309576 RASSF10A6NK89 507 aa22.95■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 FDX1P10109 184 aa22.95■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 LBX2Q6XYB7 198 aa22.95■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.95■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.95■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 AMNQ9BXJ7 453 aa22.95■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.95■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 H3BQV1 296 aa22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 MMP1P03956 469 aa22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 NUCB2P80303 420 aa22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 IFFO2Q5TF58 517 aa22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 CCDC174Q6PII3 467 aa22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 FBXO11Q86XK2 927 aa22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 MYH6P13533 1939 aa22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 ICAM1P05362 532 aa22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.94■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 PDHXO00330 501 aa22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 ADAMTS3O15072 1205 aa22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 XBP1P17861 261 aa22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 ZIC5Q96T25 663 aa22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 ZBED4O75132 1171 aa22.92■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 NAPAP54920 295 aa22.92■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 HERVK_113P62684 666 aa22.92■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 TRIM29Q14134 588 aa22.92■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.92■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 ATP2A1O14983 1001 aa22.92■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.92■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 USH1GQ495M9 461 aa22.92■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.92■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 PCNTO95613 3336 aa22.91■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 ESYT2A0FGR8 921 aa22.91■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 OPLAHO14841 1288 aa22.91■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 CYP2C8P10632 490 aa22.91■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 OSBPP22059 807 aa22.91■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 OAZ1P54368 228 aa22.91■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.91■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.91■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 OXER1Q8TDS5 423 aa22.91■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 KIF28PB7ZC32 967 aa22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 NLRP5P59047 1200 aa22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 CPXCR1Q8N123 301 aa22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 BTBD7Q9P203 1132 aa22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 SMCO2A6NFE2 343 aa22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 BTBD18B2RXH4 712 aa22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 PEX10O60683 326 aa22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 INHBEP58166 350 aa22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 FERMT3Q86UX7 667 aa22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 MB21D1Q8N884 522 aa22.9■■□□□ 1.26
PPARG-202ENST00000309576 M0R2N6 131 aa22.89■■□□□ 1.25
PPARG-202ENST00000309576 CNMDO75829 334 aa22.89■■□□□ 1.25
PPARG-202ENST00000309576 F13A1P00488 732 aa22.89■■□□□ 1.25
PPARG-202ENST00000309576 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.255e-6■■■■□ 19.8
PPARG-202ENST00000309576 RESTQ13127 1097 aa22.89■■□□□ 1.25
PPARG-202ENST00000309576 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.89■■□□□ 1.25
PPARG-202ENST00000309576 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.89■■□□□ 1.25
PPARG-202ENST00000309576 PNMA3Q9UL41 463 aa22.89■■□□□ 1.25
PPARG-202ENST00000309576 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.89■■□□□ 1.25
PPARG-202ENST00000309576 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.89■■□□□ 1.25
PPARG-202ENST00000309576 RIPK3Q9Y572 518 aa22.89■■□□□ 1.25
PPARG-202ENST00000309576 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms