RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 BACE1P56817 501 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC39A14Q15043 492 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 RTN1Q16799 776 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 SIAH1Q8IUQ4 282 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 WASF1Q92558 559 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 ESR2Q92731 530 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 CEP95Q96GE4 821 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 UBAC1Q9BSL1 405 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 THSD7BQ9C0I4 1608 aa18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFA8P51970 172 aa18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 IFNL1Q8IU54 200 aa18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 JMYQ8N9B5 988 aa18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 RAD21O60216 631 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 RCAN1P53805 252 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 INHBEP58166 350 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 MOGSQ13724 837 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 FANCBQ8NB91 859 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 PTPRFP10586 1907 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 BTBD19C9JJ37 291 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 PCP11498 1178 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 SEC23AQ15436 765 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 STX1AQ16623 288 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM22Q8IYM9 498 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF654Q8IZM8 581 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 SDF4Q9BRK5 362 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 MTMR4Q9NYA4 1195 aa18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1-201ENST00000307180 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 TRPA1O75762 1119 aa18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 CMA1P23946 247 aa18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 TREML2Q5T2D2 321 aa18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 NBPF11Q86T75 865 aa18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 EMILIN3Q9NT22 766 aa18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 TSKSQ9UJT2 592 aa18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 STX8Q9UNK0 236 aa18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 C19orf81C9J6K1 198 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF186Q9NXI6 227 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 TNKSO95271 1327 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 TPM3P06753 285 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 IQCB1Q15051 598 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 SH3D19Q5HYK7 790 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 GPAT2Q6NUI2 795 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 USP17L2Q6R6M4 530 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 NUP133Q8WUM0 1156 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 ANO10Q9NW15 660 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 WBP1LQ9NX94 342 aa18.13■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 PDHXO00330 501 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP6R2O75170 966 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 TTLL1O95922 423 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP2R5BQ15173 497 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 PTPAQ15257 358 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 SPC24Q8NBT2 197 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP3K14Q99558 947 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 NYAP2Q9P242 653 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 TMX2Q9Y320 296 aa18.12■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 DEXIO95424 95 aa18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 MMP1P03956 469 aa18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 USP14P54578 494 aa18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 MTMR7Q9Y216 660 aa18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF202O95125 648 aa18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D8O95759 1140 aa18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD23Q86SG2 305 aa18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1-201ENST00000307180 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms