RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 ASNSP08243 561 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 BMP3P12645 472 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 ECE1P42892 770 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 PTGDRQ13258 359 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 INF2Q27J81 1249 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 CSRNP2Q9H175 543 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 GPRC5DQ9NZD1 345 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 TMX2Q9Y320 296 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 STX1AQ16623 288 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 SPECC1Q5M775 1068 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 ACER1Q8TDN7 264 aa11.98□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 PARP14Q460N5 1801 aa11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 CUL5Q93034 780 aa11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 SYT17Q9BSW7 474 aa11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 PHIPQ8WWQ0 1821 aa11.97□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 TMEM232C9JQI7 657 aa11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 UVSSAQ2YD98 709 aa11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 NEK8Q86SG6 692 aa11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 VCPKMTQ9H867 229 aa11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 RIC8AQ9NPQ8 531 aa11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 SMCHD1A6NHR9 2005 aa11.96□□□□□ -0.49
COPS2-201ENST00000299259 CAVIN2O95810 425 aa11.96□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 STAT2P52630 851 aa11.96□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.96□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 CNNM3Q8NE01 707 aa11.96□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 FEZ1Q99689 392 aa11.96□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.96□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 GINM1Q9NU53 330 aa11.96□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 TMEM260Q9NX78 707 aa11.96□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 GGA3Q9NZ52 723 aa11.96□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 OTOFQ9HC10 1997 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 LAD1O00515 517 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 LETM2Q2VYF4 491 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 FAM83BQ5T0W9 1011 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 DCAF15Q66K64 600 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 TBCKQ8TEA7 893 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 HOOK2Q96ED9 719 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 AMNQ9BXJ7 453 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 ANO10Q9NW15 660 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 RNF181Q9P0P0 153 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 WDR90Q96KV7 1748 aa11.95□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.51e-8■■□□□ 11.9
COPS2-201ENST00000299259 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 UBE2SQ16763 222 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 LONRF3Q496Y0 759 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 USP49Q70CQ1 688 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 NEMFO60524 1076 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 OR52Z1P0C646 297 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 PRPHP41219 470 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 EPS15P42566 896 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 ZNF165P49910 485 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 FBXO11Q86XK2 927 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 PDILTQ8N807 584 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 EPSTI1Q96J88 318 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.94□□□□□ -0.5
COPS2-201ENST00000299259 CBX8Q9HC52 389 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms