RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 DISC1Q9NRI5 854 aa28.33■■■□□ 2.13
CTBP1-201ENST00000290921 TFR2Q9UP52 801 aa28.33■■■□□ 2.13
CTBP1-201ENST00000290921 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 MMS19Q96T76 1030 aa28.32■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 MED4Q9NPJ6 270 aa28.32■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 SAR1BQ9Y6B6 198 aa28.32■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 MYO1CO00159 1063 aa28.32■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 IVLP07476 585 aa28.32■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 PRDX5P30044 214 aa28.32■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 BLIDQ8IZY5 108 aa28.32■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 THAP9Q9H5L6 903 aa28.31■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.31■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.31■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 CASZ1Q86V15 1759 aa28.31■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.31■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.31■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 SRGAP2O75044 1071 aa28.31■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 NAALADL2Q58DX5 795 aa28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 SRLQ86TD4 932 aa28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 TRIM47Q96LD4 638 aa28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 RPS6KA5O75582 802 aa28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 KRT83P78385 493 aa28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 KCNB1Q14721 858 aa28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 RASSF8Q8NHQ8 419 aa28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 VIPAS39Q9H9C1 493 aa28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 STIM1Q13586 685 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 KIAA1328Q86T90 577 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 KAT14Q9H8E8 782 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 KLRC4O43908 158 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 MCM3P25205 808 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 DTHD1Q6ZMT9 781 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 C10orf67Q8IYJ2 551 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 JAKMIP2Q96AA8 810 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 RASSF4Q9H2L5 321 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 PP2D1A8MPX8 630 aa28.28■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 PSMA7O14818 248 aa28.28■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 DNM2P50570 870 aa28.28■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 SLC10A5Q5PT55 438 aa28.28■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 RASGRP4Q8TDF6 673 aa28.28■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 CAPZA3Q96KX2 299 aa28.28■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 FAM204AQ9H8W3 233 aa28.28■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 TRIM66O15016 1216 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 MAP9Q49MG5 647 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF662Q6ZS27 426 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 B4DLN1 442 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 KRT86O43790 486 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 MEA1Q16626 185 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 EHBP1Q8NDI1 1231 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 PLIN2Q99541 437 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 TRIM34Q9BYJ4 488 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-201ENST00000290921 SRGNP10124 158 aa28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.112e-6■■■■■ 37.7
CTBP1-201ENST00000290921 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 MAST2Q6P0Q8 1798 aa28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 RNF40O75150 1001 aa28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 RHOBTB3O94955 611 aa28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 TTI2Q6NXR4 508 aa28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 FOXR1Q6PIV2 292 aa28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 EXOC1Q9NV70 894 aa28.26■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 KCNQ2O43526 872 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 SYF2O95926 243 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 USP17L8P0C7I0 530 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.25■■■□□ 2.11
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CTBP1-201ENST00000290921 DGKHQ86XP1 1220 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 PNMA1Q8ND90 353 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 IL17RBQ9NRM6 502 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 M0R2N6 131 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 UBA7P41226 1012 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 TFAP4Q01664 338 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-201ENST00000290921 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
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