RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF536O15090 1300 aa22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 BRCA2P51587 3418 aa22.21■■□□□ 1.15
MALSU1-201ENST00000287543 H0YGN5 161 aa22.2■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 DNM1LO00429 736 aa22.2■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 ICAM1P05362 532 aa22.2■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC174Q6PII3 467 aa22.2■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.2■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.2■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.2■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 RNF146Q9NTX7 359 aa22.2■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.2■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 PFASO15067 1338 aa22.2■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 COL6A1P12109 1028 aa22.19■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 ALAS1P13196 640 aa22.19■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.19■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 PNMA1Q8ND90 353 aa22.19■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.19■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 POTEB2H3BUK9 544 aa22.18■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 SLC16A2P36021 539 aa22.18■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.18■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 MAP4K1Q92918 833 aa22.18■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 TNKSO95271 1327 aa22.17■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 RARBP10826 455 aa22.17■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 AKR1A1P14550 325 aa22.17■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 PTH1RQ03431 593 aa22.17■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.17■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 KBTBD13C9JR72 458 aa22.16■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 CYP21A2P08686 494 aa22.16■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.16■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.16■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.16■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.16■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.16■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 ERICH2A1L162 156 aa22.15■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 ASB14A6NK59 587 aa22.15■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 SNAP25P60880 206 aa22.15■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.15■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 NCOA7Q8NI08 942 aa22.15■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.14■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.14■■□□□ 1.14
MALSU1-201ENST00000287543 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 NEFLP07196 543 aa22.14■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 CASC1Q6TDU7 716 aa22.14■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 RNF180Q86T96 592 aa22.14■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 MAF1Q9H063 256 aa22.14■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.14■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 ACVR2BQ13705 512 aa22.13■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.13■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.13■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 E7EWF7 191 aa22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 ANO1Q5XXA6 986 aa22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 NSMFQ6X4W1 530 aa22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 ARMCX2Q7L311 632 aa22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 MYH4Q9Y623 1939 aa22.12■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 PARP14Q460N5 1801 aa22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 CNTN2Q02246 1040 aa22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 LRRC41Q15345 812 aa22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 SEC23AQ15436 765 aa22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 MTA3Q9BTC8 594 aa22.11■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.1■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 RGS22Q8NE09 1264 aa22.1■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 FGD4Q96M96 766 aa22.1■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.1■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 SPC25Q9HBM1 224 aa22.1■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.09■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 B4DLN1 442 aa22.08■■□□□ 1.13
MALSU1-201ENST00000287543 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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