RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PP2D1A8MPX8 630 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 B4DLN1 442 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 MCM3P25205 808 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PARP10Q53GL7 1025 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 KIAA1328Q86T90 577 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 TRIM47Q96LD4 638 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.73■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 RASSF10A6NK89 507 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 CAMTA2O94983 1202 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 SRGNP10124 158 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 DNM2P50570 870 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 MAP9Q49MG5 647 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 TTI2Q6NXR4 508 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 KRT86O43790 486 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 RHOBTB3O94955 611 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 CALML3P27482 149 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 HSPA1LP34931 641 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 EHBP1Q8NDI1 1231 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 COG1Q8WTW3 980 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 RREB1Q92766 1687 aa16.72■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 LAMB2P55268 1798 aa16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PSMA7O14818 248 aa16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 ZMYND10O75800 440 aa16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 KLK7P49862 253 aa16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 DTHD1Q6ZMT9 781 aa16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 EXOC1Q9NV70 894 aa16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
SYP-201ENST00000263233 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF185O15231 689 aa16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 STIM1Q13586 685 aa16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 RCSD1Q6JBY9 416 aa16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 LRRC15Q8TF66 581 aa16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 PLIN2Q99541 437 aa16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.71■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 MYBL2P10244 700 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 CYP2D6P10635 497 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 RASSF8Q8NHQ8 419 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 LAMB1P07942 1786 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 M0R2N6 131 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 MYL1P05976 194 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 UBE4AQ14139 1066 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 C8orf37Q96NL8 207 aa16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 SCN7AQ01118 1682 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 ANO9A1A5B4 782 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 NUP58Q9BVL2 599 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 KIF5BP33176 963 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 UBA7P41226 1012 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 ZBED6P86452 979 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 RETREG2Q8NC44 543 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 CAGE1Q8TC20 777 aa16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 TSPY2A6NKD2 308 aa16.68■□□□□ 0.26
SYP-201ENST00000263233 AGPSO00116 658 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms