RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258796.11

TTYH3-201, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTYH3, Length 4,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-201ENST00000258796 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.69■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 RIMBP2O15034 1052 aa21.69■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 WDR44Q5JSH3 913 aa21.69■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 NAA35Q5VZE5 725 aa21.69■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.69■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.69■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.69■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 HIP1RO75146 1068 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 TRAPPC10P48553 1259 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 VPS52Q8N1B4 723 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 GREM2Q9H772 168 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 DDAH1O94760 285 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 NNTQ13423 1086 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 MAGEA9P43362 315 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 GYG1P46976 350 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 P2RX5Q93086 422 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 LTKP29376 864 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 RDH13Q8NBN7 331 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 FNBP1Q96RU3 617 aa21.68■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC169A6NNP5 214 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 DDIT3P35638 169 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 RESP18Q5W5W9 173 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ANKRD7Q92527 254 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 PAGE5Q96GU1 130 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ADD2P35612 726 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ZBED6P86452 979 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 KRT31Q15323 416 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 KLRF2D3W0D1 207 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ABCA8O94911 1581 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 VCXQ9H320 206 aa21.67■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 LIN9Q5TKA1 542 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ADAM9Q13443 819 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 E2F5Q15329 346 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ST7Q9NRC1 585 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 USTQ9Y2C2 406 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 MED14O60244 1454 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 MOCS3O95396 460 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 SLC1A4P43007 532 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 IFNAR2P48551 515 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 SLC7A5Q01650 507 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 CFAP157Q5JU67 520 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 PANK4Q9NVE7 773 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 VEZTQ9HBM0 779 aa21.66■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 RASSF2P50749 326 aa21.65■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 SP4Q02446 784 aa21.65■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.65■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 GALNT17Q6IS24 598 aa21.65■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 EYA3Q99504 573 aa21.65■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 TBC1D8O95759 1140 aa21.64■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.64■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.64■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.64■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 UFL1O94874 794 aa21.64■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.64■■□□□ 1.06
TTYH3-201ENST00000258796 USP6P35125 1406 aa21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 LIFRP42702 1097 aa21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 VPS41P49754 854 aa21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 SMTNP53814 917 aa21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 IQCB1Q15051 598 aa21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 ARHGAP24Q8N264 748 aa21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 BANK1Q8NDB2 785 aa21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 CUEDC2Q9H467 287 aa21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.63■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 ALS2CLQ60I27 953 aa21.63■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC110Q8TBZ0 833 aa21.63■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TTYH3-201ENST00000258796 PTPREP23469 700 aa21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms