RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CRHR2Q13324 411 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ENGASEQ8NFI3 743 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPY2A6NKD2 308 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2C8P10632 490 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC144BQ3MJ40 725 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 STOX1Q6ZVD7 989 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS22Q8NE09 1264 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 KANSL2Q9H9L4 492 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBB4AP04350 444 aa30.08■■■□□ 2.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 B4E1Z4 1266 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN14Q15678 1187 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 SPICE1Q8N0Z3 855 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX11Q96FC9 970 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 MTMR4Q9NYA4 1195 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQ27 194 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQ64 194 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQD8 194 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPDC1A2A3K4 754 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD23Q86SG2 305 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 BPIFA3Q9BQP9 254 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC285556D6RIA3 1793 aa30.07■■■□□ 2.4
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CAPNS1-201ENST00000246533 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
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CAPNS1-201ENST00000246533 LBX1P52954 281 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 TMX2Q9Y320 296 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf81C9J6K1 198 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PLIN4Q96Q06 1357 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH4Q9Y623 1939 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SKILP12757 684 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CA12O43570 354 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L2Q6R6M4 530 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 TMOD4Q9NZQ9 345 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 E7EWF7 191 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 VCAM1P19320 739 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ6P48051 423 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 RTEL1Q9NZ71 1219 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSWIM5Q9P217 1185 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD21O60216 631 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX10O60683 326 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CTDNEP1O95476 244 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 EVCP57679 992 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ADALQ6DHV7 355 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
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CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 USP28Q96RU2 1077 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NYAP2Q9P242 653 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 STX8Q9UNK0 236 aa30.02■■■□□ 2.4
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CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf42Q96LP6 360 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-201ENST00000246533 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
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CAPNS1-201ENST00000246533 CYB5R4Q7L1T6 521 aa30.01■■■□□ 2.39
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CAPNS1-201ENST00000246533 ERO1AQ96HE7 468 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL1O95922 423 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ME1P48163 572 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST3Q7LGC8 479 aa30■■■□□ 2.39
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CAPNS1-201ENST00000246533 KIF18AQ8NI77 898 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ESR2Q92731 530 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 VCPKMTQ9H867 229 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 PCP11498 1178 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 USP14P54578 494 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CCZ1BP86790 482 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CAP1Q01518 475 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 RCSD1Q6JBY9 416 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEEQ6S8J3 1075 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC150Q8NCX0 1101 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CPA4Q9UI42 421 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 NRDCO43847 1150 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 TPM4P67936 248 aa29.99■■■□□ 2.39
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