RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000207173.2

Gm3854-201, Transcript of Predicted gene 3854, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Gm3854, Length 2,950 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3854-201ENSMUST00000207173 HunkO88866 714 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 FosbP13346 338 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Hoxa11P31311 313 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 CebpaP53566 359 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Pla2g6P97819 807 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Ubash3aQ3V3E1 624 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Kansl1lQ5DTI6 991 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 PogkQ80TC5 607 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Fez1Q8K0X8 392 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Dnai2A2AC93 623 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Zbtb21E9Q444 1094 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 DSCC1Q14AI0 399 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Nt5c2Q3V1L4 560 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Tnni3kQ5GIG6 834 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Cnnm4Q69ZF7 771 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Entpd3Q8BFW6 529 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Myo1hQ9D6A1 958 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Gjd2O54851 321 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 NefhP19246 1090 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Gna11P21278 359 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Slc9a1Q61165 820 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Tmem60Q8K174 133 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Plcd1Q8R3B1 756 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Gm28047Q3US59 414 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Casc1Q6TDU8 730 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Mbtps2Q8CHX6 515 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Bicd2Q921C5 820 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Bco2Q99NF1 532 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Trappc10Q3TLI0 1259 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Cnga2Q62398 664 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Gja3Q64448 417 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Ccdc142Q8CAI1 738 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Serpinb13Q8CDC0 389 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Usp26Q99MX1 835 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Cul5Q9D5V5 780 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Armc3A2AU72 881 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Wnt7aP24383 349 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 VegfbP49766 207 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Gjb4Q02738 266 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Mrgprb1Q3UG61 350 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Gba2Q69ZF3 918 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Dcaf8Q8N7N5 591 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Zbtb12Q9Z150 459 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 LtbrP50284 415 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Morf4l1P60762 362 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Psg29Q3URN6 468 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Olfm4Q3UZZ4 505 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Oxr1Q4KMM3 866 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Fbxo10Q7TQF2 950 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Stard7Q8R1R3 373 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Bhmt2Q91WS4 363 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 F11Q91Y47 624 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Kctd10Q922M3 315 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Cmtm5Q9D6G9 156 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 OgdhlE9Q7L0 1029 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Gucy1a2F8VQK3 730 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Eps15P42567 897 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Traf5P70191 558 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Mtmr3Q8K296 1196 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Hip1rQ9JKY5 1068 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Sel1lQ9Z2G6 790 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Disp2Q8CIP5 1345 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Ankrd35E9Q9D8 996 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Lig1P37913 916 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Nol12Q8BG17 217 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 R3hcc1Q8BSI6 488 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Usp33Q8R5K2 909 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Igbp1bQ9QZ29 343 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Ampd3O08739 766 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 AoahO35298 574 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Cd22P35329 862 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 NfibP97863 570 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Pou2f2Q00196 463 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Yy1Q00899 414 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 SelpQ01102 768 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Usp28Q5I043 1051 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm3854-201ENSMUST00000207173 Znf219Q6IQX8 726 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.3 ms