RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	SORBS3	O60504	671 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ADH6	P28332	368 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	MAP2K3	P46734	347 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GPSM2	P81274	684 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PSMD14	O00487	310 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ARAF	P10398	606 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ACPP	P15309	386 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GPLD1	P80108	840 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	POLL	Q9UGP5	575 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	APAF1	O14727	1248 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TRPA1	O75762	1119 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	KIF4A	O95239	1232 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TNIP1	Q15025	636 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	USP48	Q86UV5	1035 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	AK5	Q9Y6K8	562 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A1W2PP55	124 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ECE2	O60344	883 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PCSK7	Q16549	785 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM35A	Q86V20	835 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CEP120	Q8N960	986 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TNFRSF25	Q93038	417 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ABHD8	Q96I13	439 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	OSMR	Q99650	979 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	MYD88	Q99836	296 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	BCO2	Q9BYV7	579 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	EHD4	Q9H223	541 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	VPS33B	Q9H267	617 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	HYPK	Q9NX55	129 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CACNA1F	O60840	1977 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	RTL9	Q8NET4	1388 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ADM5	C9JUS6	153 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GHRH	P01286	108 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF853	P0CG23	659 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CPB1	P15086	417 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ADH7	P40394	386 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ECE1	P42892	770 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	KRT76	Q01546	638 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CCDC184	Q52MB2	194 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TREML4	Q6UXN2	200 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658		H7C1D1	291 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	HOXB7	P09629	217 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	VAMP1	P23763	118 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	GRM2	Q14416	872 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	TSPYL6	Q8N831	410 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	BACH2	Q9BYV9	841 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	GIPC1	O14908	333 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	UFL1	O94874	794 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	ATP11A	P98196	1134 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MFSD8-240	ENST00000641658	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		7.07	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms