RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	MFAP3L	O75121	409 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	MECOM	Q03112	1051 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	MAGEA1	P43355	309 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	POLD4	Q9HCU8	107 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	PRCP	P42785	496 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	CPD	O75976	1380 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNQ2	O43526	872 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	GNA11	P29992	359 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	PLS1	Q14651	629 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.15	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	UFL1	O94874	794 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31	1e-18	■■■■■ 447.2
SPIN3-223	ENST00000639525	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	NTRK3	Q16288	839 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	BMP6	P22004	513 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	BRD3	Q15059	726 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	MCM3	P25205	808 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	EYA3	Q99504	573 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525		H7C1D1	291 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	NDUFA10	O95299	355 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TCP10	Q12799	353 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	COA7	Q96BR5	231 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	C3	P01024	1663 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	SMIM23	A6NLE4	172 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	HSF2BP	O75031	334 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP1A2	P50993	1020 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	GUCY2F	P51841	1108 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	C2orf54	Q08AI8	447 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC151	A5D8V7	595 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	PLCG1	P19174	1290 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CASP8	Q14790	479 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	VSNL1	P62760	191 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	EVX2	Q03828	476 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	CALCRL	Q16602	461 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-223	ENST00000639525	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		13.12	□□□□□ -0.31

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