RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 TACC3Q9Y6A5 838 aa34.31■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 OLFML2BQ68BL8 750 aa34.3■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 MTMR7Q9Y216 660 aa34.3■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM232C9JQI7 657 aa34.29■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 EVI5O60447 810 aa34.29■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 MCCP23508 829 aa34.29■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC1A4P43007 532 aa34.29■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 IL17RBQ9NRM6 502 aa34.29■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 ZMYM6O95789 1325 aa34.29■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 MYH4Q9Y623 1939 aa34.28■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 PGK2P07205 417 aa34.28■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 C11orf49Q9H6J7 331 aa34.28■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 PARP14Q460N5 1801 aa34.27■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 PDE4AP27815 886 aa34.27■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 LHX8Q68G74 356 aa34.27■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 GMCL1Q96IK5 515 aa34.27■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 FGRP09769 529 aa34.26■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 STAT2P52630 851 aa34.26■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 MFSD6Q6ZSS7 791 aa34.26■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 MAML3Q96JK9 1138 aa34.26■■■■□ 3.08
SEMA3B-215ENST00000621029 CHURC1Q8WUH1 139 aa34.25■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 DDX11Q96FC9 970 aa34.25■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa34.25■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF213O14771 459 aa34.24■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 MSCO60682 206 aa34.24■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 AKNAD1Q5T1N1 836 aa34.24■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM160B2Q86V87 743 aa34.24■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 TRPV1Q8NER1 839 aa34.24■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 RIPK3Q9Y572 518 aa34.24■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF236Q9UL36 1845 aa34.24■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 CYBAP13498 195 aa34.23■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 KCTD1Q719H9 257 aa34.23■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 STAG1Q8WVM7 1258 aa34.23■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC96Q2M329 555 aa34.22■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa34.22■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 TTC22Q5TAA0 569 aa34.22■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 RCSD1Q6JBY9 416 aa34.22■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP2A1O14983 1001 aa34.21■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 PCP11498 1178 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 TBC1D10CQ8IV04 446 aa34.21■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 CEP290O15078 2479 aa34.21■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHA2P01877 340 aa34.2■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 FDX1P10109 184 aa34.2■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
SEMA3B-215ENST00000621029 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 TOP1P11387 765 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 OAZ1P54368 228 aa34.19■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF792Q3KQV3 632 aa34.19■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 ANO1Q5XXA6 986 aa34.19■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 HOMER2Q9NSB8 354 aa34.19■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 CHRDL2Q6WN34 429 aa34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 RASGRP2Q7LDG7 609 aa34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 C7orf61Q8IZ16 206 aa34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD35Q8N283 1001 aa34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 ESR2Q92731 530 aa34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM47Q9BQJ4 181 aa34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 TINF2Q9BSI4 451 aa34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 FBXO40Q9UH90 709 aa34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 SEPT4O43236 478 aa34.17■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 DCAF4Q8WV16 495 aa34.17■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 DSCC1Q9BVC3 393 aa34.17■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 CTNNA3Q9UI47 895 aa34.17■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 NOVP48745 357 aa34.16■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC174Q6PII3 467 aa34.16■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 CHST13Q8NET6 341 aa34.16■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 SNAP25P60880 206 aa34.15■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 PRR12Q9ULL5 1215 aa34.15■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 PFASO15067 1338 aa34.14■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 NEDD4P46934 1319 aa34.14■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 PLA2G6O60733 806 aa34.14■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 ARRDC4Q8NCT1 418 aa34.14■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 AGBL1Q96MI9 1066 aa34.14■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 CNPY2Q9Y2B0 182 aa34.14■■■■□ 3.06
SEMA3B-215ENST00000621029 TTC14Q96N46 770 aa34.13■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa34.13■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 GPCPD1Q9NPB8 672 aa34.13■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 COL6A1P12109 1028 aa34.12■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 RUFY2Q8WXA3 655 aa34.12■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 ACAD9Q9H845 621 aa34.12■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF146Q9NTX7 359 aa34.12■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 NRBP1Q9UHY1 535 aa34.12■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 KDM4AO75164 1064 aa34.11■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 ALAS1P13196 640 aa34.11■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC16A2P36021 539 aa34.11■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 TTBK2Q6IQ55 1244 aa34.11■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 KBTBD13C9JR72 458 aa34.1■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 DNM1LO00429 736 aa34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms