RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.29■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.29■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.29■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.29■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 FEM1BQ9UK73 627 aa24.29■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.29■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 STK36Q9NRP7 1315 aa24.29■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 GJB2P29033 226 aa24.28■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 SNAP25P60880 206 aa24.28■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.28■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 PTPN18Q99952 460 aa24.28■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.28■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 CREBZFQ9NS37 354 aa24.28■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 STAT2P52630 851 aa24.27■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.27■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 PIGSQ96S52 555 aa24.27■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 ZIC5Q96T25 663 aa24.27■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.27■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.27■■□□□ 1.48
CSAG3-202ENST00000617158 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 CDKL5O76039 1030 aa24.26■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 GTF2A2P52657 109 aa24.26■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 FAM160B2Q86V87 743 aa24.26■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.26■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.26■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.26■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 RASSF10A6NK89 507 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L15C9J2P7 530 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 BTBD19C9JJ37 291 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L11C9JVI0 530 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L18D6R9N7 530 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L22D6RA61 530 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L19D6RCP7 530 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L20D6RJB6 530 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 CETPP11597 493 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L24Q0WX57 530 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 CCL15Q16663 113 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 DSG3P32926 999 aa24.24■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.24■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 KIFC2Q96AC6 838 aa24.24■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 ATG4CQ96DT6 458 aa24.24■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 FLOT1O75955 427 aa24.23■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 HTRA3P83110 453 aa24.23■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.23■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.23■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 REPS2Q8NFH8 660 aa24.23■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC102AQ96A19 550 aa24.23■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF536O15090 1300 aa24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 DEXIO95424 95 aa24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 COG2Q14746 738 aa24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 HOMER1Q86YM7 354 aa24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.21■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 SCG2P13521 617 aa24.21■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.21■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.21■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.21■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.21■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 ALG1Q9BT22 464 aa24.21■■□□□ 1.47
CSAG3-202ENST00000617158 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CSAG3-202ENST00000617158 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB5O15062 677 aa24.2■■□□□ 1.46
CSAG3-202ENST00000617158 ADAMTS3O15072 1205 aa24.2■■□□□ 1.46
CSAG3-202ENST00000617158 PEX10O60683 326 aa24.2■■□□□ 1.46
CSAG3-202ENST00000617158 FOSBP53539 338 aa24.2■■□□□ 1.46
CSAG3-202ENST00000617158 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms