RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613667.1

LINC00649-216, long intergenic non-protein coding RNA 649, human

TSL 5

Gene LINC00649, Length 827 nt, Biotype antisense RNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00649-216	ENST00000613667	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	FKTN	O75072	461 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	HTRA3	P83110	453 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	PLAT	P00750	562 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	ATF2	P15336	505 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	PDE4B	Q07343	736 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	CDSN	Q15517	529 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	VPS11	Q9H270	941 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	PRKCA	P17252	672 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	FOXO4	P98177	505 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINC00649-216	ENST00000613667	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	CYP4F8	P98187	520 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	KLF10	Q13118	480 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	CARF	Q8N187	725 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	SYP	P08247	313 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	PLCG1	P19174	1290 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TNNI2	P48788	182 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TGFB2	P61812	414 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TREH	O43280	583 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	MC3R	P41968	323 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	INHBE	P58166	350 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	NR1I3	Q14994	352 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	DNAJA2	O60884	412 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	AMH	P03971	560 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	RGS19	P49795	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	MVK	Q03426	396 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LINC00649-216	ENST00000613667	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms