RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKS1AQ92625 1134 aa13.31□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 UBAC1Q9BSL1 405 aa13.31□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa13.31□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 CENPFP49454 3210 aa13.31□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 REC8O95072 547 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 GNRH1P01148 92 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 ANTXR2P58335 489 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 ARHGEF6Q15052 776 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC178Q5BJE1 867 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF20Q5VTR2 975 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 CHST3Q7LGC8 479 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 TNS4Q8IZW8 715 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 SLF1Q9BQI6 1058 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PORCNQ9H237 461 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 MTMR7Q9Y216 660 aa13.3□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 VWA5AO00534 786 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 SNHG28P0DPA3 235 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PDHBP11177 359 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 HSPA4P34932 840 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 TSGA10IPQ3SY00 556 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 KCTD1Q719H9 257 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 MB21D1Q8N884 522 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 REPS2Q8NFH8 660 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 DCAF4Q8WV16 495 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 FEM1BQ9UK73 627 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PLXNB2O15031 1838 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM232C9JQI7 657 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 STAT2P52630 851 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM132BQ14DG7 1078 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 ADCK5Q3MIX3 580 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PNMA1Q8ND90 353 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNB2Q92953 911 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 KIFC2Q96AC6 838 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 KAT14Q9H8E8 782 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 SRRDQ9UH36 339 aa13.29□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PLA2G6O60733 806 aa13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PRKCZQ05513 592 aa13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 USP26Q9BXU7 913 aa13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 SENP2Q9HC62 589 aa13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 GABRQQ9UN88 632 aa13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PRC1O43663 620 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 HOXD10P28358 340 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 MAPK4P31152 587 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 MCM5P33992 734 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 PRMT2P55345 433 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 CCNA1P78396 465 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF543Q08ER8 600 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC96Q2M329 555 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 TTBK2Q6IQ55 1244 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR142Q7Z601 462 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM160B2Q86V87 743 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 COA7Q96BR5 231 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 NEK1Q96PY6 1258 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 GJD2Q9UKL4 321 aa13.27□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 ERICH2A1L162 156 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC16A2P36021 539 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 FLT3LGP49771 235 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 IKQ13123 557 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 PLS1Q14651 629 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 WTAPQ15007 396 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM67Q5HYA8 995 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 BTNL9Q6UXG8 535 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 ABHD8Q96I13 439 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 MTA3Q9BTC8 594 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 PRR12Q9ULL5 1215 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 HPS5Q9UPZ3 1129 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 SNX14Q9Y5W7 946 aa13.26□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP2A1O14983 1001 aa13.25□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 GOLGA8HP0CJ92 632 aa13.25□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 ERCC3P19447 782 aa13.25□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 STAT3P40763 770 aa13.25□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 KRT32Q14532 448 aa13.25□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 SHCBP1Q8NEM2 672 aa13.25□□□□□ -0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM87BQ96K49 555 aa13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms