RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602710.5

UBE2E3-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-209ENST00000602710 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.08■■□□□ 1.13
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UBE2E3-209ENST00000602710 HOMER1Q86YM7 354 aa22.08■■□□□ 1.13
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UBE2E3-209ENST00000602710 TREML2Q5T2D2 321 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-209ENST00000602710 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-209ENST00000602710 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.08■■□□□ 1.12
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UBE2E3-209ENST00000602710 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM160B2Q86V87 743 aa22.06■■□□□ 1.12
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UBE2E3-209ENST00000602710 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.05■■□□□ 1.12
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UBE2E3-209ENST00000602710 PARP14Q460N5 1801 aa22.05■■□□□ 1.12
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UBE2E3-209ENST00000602710 SCG2P13521 617 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3-209ENST00000602710 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
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UBE2E3-209ENST00000602710 CCL15Q16663 113 aa22.02■■□□□ 1.12
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UBE2E3-209ENST00000602710 DSG3P32926 999 aa22■■□□□ 1.11
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UBE2E3-209ENST00000602710 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
UBE2E3-209ENST00000602710 COA7Q96BR5 231 aa22■■□□□ 1.11
UBE2E3-209ENST00000602710 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22■■□□□ 1.11
UBE2E3-209ENST00000602710 MTMR6Q9Y217 621 aa22■■□□□ 1.11
UBE2E3-209ENST00000602710 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22■■□□□ 1.11
UBE2E3-209ENST00000602710 H3BQV1 296 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2E3-209ENST00000602710 STXBP3O00186 592 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2E3-209ENST00000602710 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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