RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600209.5

FCHO1-232, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-232ENST00000600209 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.33■■□□□ 1.33
FCHO1-232ENST00000600209 GNAQP50148 359 aa23.33■■□□□ 1.33
FCHO1-232ENST00000600209 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
FCHO1-232ENST00000600209 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.33■■□□□ 1.33
FCHO1-232ENST00000600209 MB21D1Q8N884 522 aa23.33■■□□□ 1.33
FCHO1-232ENST00000600209 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.33■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 SMARCA1P28370 1054 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 C17orf99Q6UX52 265 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 MICU3Q86XE3 530 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 KIFC2Q96AC6 838 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 VWA5AO00534 786 aa23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 ATG4CQ96DT6 458 aa23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 ST18O60284 1047 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 ZBED4O75132 1171 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 RXRAP19793 462 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 SLC16A2P36021 539 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 MYH6P13533 1939 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 NID2Q14112 1375 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 BCRP11274 1271 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 RTN1Q16799 776 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 CPA4Q9UI42 421 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 ATP2A1O14983 1001 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 CNMDO75829 334 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 OAZ1P54368 228 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 REPS2Q8NFH8 660 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 BTBD7Q9P203 1132 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-232ENST00000600209 GPR25O00155 361 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 ERVK-9P63128 1117 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 ERVK-24P63145 666 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 Q3C1V9 767 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 CPVLQ9H3G5 476 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 PNMA2Q9UL42 364 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 PFKFB2O60825 505 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 CDC27P30260 824 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 MCM2P49736 904 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 SP3Q02447 781 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 NBPF11Q86T75 865 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 MTMR8Q96EF0 704 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 CEP350Q5VT06 3117 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 CYTH3O43739 400 aa23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 STAT3P40763 770 aa23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 CCNA1P78396 465 aa23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 STK3Q13188 491 aa23.23■■□□□ 1.31
FCHO1-232ENST00000600209 ME3Q16798 604 aa23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms